肠道微生物群是人体的第二基因组,种类超过1000种,其与肿瘤的发生相关,也能影响治疗。2019年11月,发表在《Cancer》的一研究,调查了中国高危地区食管鳞状细胞癌(ESCC)和胃贲门腺癌(GCA)的微生物特征。
背景:微生物群和上消化道肿瘤的相关研究较少。ESCC和GCA虽然组织类型不同,但均发生在邻近器官,在地理上也会同时发生,并有许多共同的风险因素。
方法:对河南省67例ESCC患者和36例GCA患者的配对肿瘤和非肿瘤样本的微生物群落特征进行分析。使用MoBio PowerSoil试剂盒提取DNA。使用MiniSeq对16S核糖体RNA基因的V4区进行测序,并使用Quantitative Insights Into Microbial Ecology 1进行处理。使用线性判别分析效果大小法,鉴别微生物丰度的差异,使用Wilcoxon rank-sum检验α多样性差异,并使用排列多变量分析检验变量的β多样性差异。
结果:ESCC和GCA组织的微生物环境均以厚壁菌、拟杆菌和变形菌为主。ESCC肿瘤组织中梭状杆菌含量(3.2% vs 1.3%)高于非肿瘤组织,链球菌的含量低于非肿瘤组织(12.0% vs 30.2%)。与肿瘤组织相比,GCA非肿瘤组织中的幽门螺杆菌丰度更高(60.5% vs 11.8%),这可能与较低的α多样性(58.0 vs 102.5;P=0.0012)相关。ESCC与GCA的非肿瘤组织的比较表明,微生物组成(P=0.0040)和α多样性(87.0 vs 58.0;P=0.00052)存在显著差异。ESCC和GCA肿瘤组织之间α多样性无显著差异。
结论:本研究显示了ESCC和GCA配对肿瘤及非肿瘤组织的微生物组成存在差异,且在不同器官部位存在差异。需要大规模的前瞻性队列研究来证实这些发现。
(选题审校:黄振城 编辑:吴星)
(本文由北京大学第三医院药剂科翟所迪教授及其团队选题并审校,环球医学资讯编辑完成。)
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Cancer. 2019 Nov 15;125(22):3993-4002.
Microbial characterizationof esophageal squamous cell carcinoma and gastric cardia adenocarcinoma from ahigh-risk region of China.
